献给初学者:常用的细胞核凋亡检测方法

2022-01-24 00:26:20 来源:
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在测试中所经常需要测出真核细胞的衰老情况,这里总结了几种常见的衰老测出方具锥体新方法,希望很难帮到你。

一真核细胞衰老的特征学测出

遭遇衰老的真核细胞在特征上有一定的不同之处。

光学全像和倒置全像

未漂白真核细胞:衰老真核细胞的锥大小变小、挤压,线粒锥体完整但不止现发泡现象,真核细胞衰老更早可见衰老小锥体。贴壁真核细胞不止现皱缩、变圆、脱落。

漂白真核细胞:常见姬姆萨漂白、瑞氏漂白等。衰老真核细胞的漂白质稀释、长期以来,核能细胞膜混合物、漂白质重新组合成颗粒状和衰老小锥体等迥然不同的衰老特征。

发光全像和总共定位激光扫描全像

一般以真核细胞核能漂白质的特征学转变为这两项来入围者真核细胞衰老的的发展情况。

常见的 DNA 抑制原料有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三种原料与 DNA 的联结都有无个人电脑的,主要联结在 DNA 的 A-T RNA一区。紫外光诱发时发射蓝白色的金色发光。

Hoechst 是与 DNA 特异联结的活性原料,储存盐酸用蒸馏水除去 1 mg/ml 的ppm,使用时用 PBS 稀释,逐ppm为 10 μg/ml。

DAPI 为半通透性,用于这两项固定真核细胞的漂白。储存盐酸用蒸馏水除去 1 mg/ml 的ppm,使用逐ppm一般为 10 μg/ml。

结果入围者

真核细胞衰老过程中所真核细胞核能漂白质的特征学转变包分作三期:Ⅰ 期的真核细胞核能呈白点状(rippled)或呈折缝样(creased),部分漂白质不止现稀释精神状态;Ⅱa 期真核细胞核能的漂白质极低度凝聚、长期以来;Ⅱb 期的真核细胞核能混合物为碎块,造成了衰老小锥体(平面图 1)。

透射电子全像仔细观察

结果入围者

衰老真核细胞锥大小变小,真核叶绿锥体稀释。衰老Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的真核细胞核能内漂白质极低度盘绕,不止现许多称之为气穴现象(citations)的空泡结构;Ⅱa 期真核细胞核能的漂白质极低度凝聚、长期以来;真核细胞衰老的更早,真核细胞核能混合物为碎块,造成了衰老小锥体(平面图 2)。

二Annexin V 具锥体新方法

脂类乙基底物(Phosphatidylserine, PS)短整整毗邻线粒锥体的后侧,但在真核细胞衰老的最初,PS 可从线粒锥体的后侧翻转到线粒锥体的表面,暴露在真核细胞外环境中所(平面图 3)。Annexin-V 是一种底物绝对值为 35~36 KD 的 Ca2+ 抑制脂类联结细胞,能与 PS 极低亲和力抑制联结。将 Annexin-V 展开发光素(FITC、PE)或 biotin 上面,以上面了的 Annexin-V 作为发光探针,运用流式真核细胞郭子或发光全像可测出真核细胞衰老的遭遇。

氯化丙啶(propidine iodide, PI)是一种核能酸原料,它不能为了让完整的线粒锥体,但在衰老中所更早的真核细胞和活着真核细胞,PI 很难为了让线粒锥体而使真核细胞核能红染。因此将 Annexin-V 与 PI 最简单使用,就可以将衰老早更早的真核细胞以及活着真核细胞一区隔开来。

方具锥体新方法

碎屑真核细胞的漂白:将短整整培养出来和作用于衰老的碎屑真核细胞(0.5~1×106)用 PBS 浸 2 次,自组 100 μl Binding Buffer 和 FITC 上面的 Annexin-V(20 μg/ml)10 μl,熔点避光 30 min,再自组 PI(50 μg/ml)5 μl,避光赞成 5 min 后,自组 400 μl Binding Buffer,立即用 FACScan 展开流式真核细胞拳法系统性测出(一般不将近 1 h), 同时以不赞 AnnexinV-FITC 及 PI 的一管作为同义相异。

贴壁培养出来的真核细胞漂白:先用 0.25% 的胰蛋白酶小肠,浸涤、漂白和比对同碎屑真核细胞。

攀片真核细胞漂白:同上,最后用发光全像和总共定位激光扫描全像展开仔细观察。

结果

注意事项

1. 整个操作动作要尽力快节奏,切勿用力吹打真核细胞。

2. 操作时注意避光,赞成完毕后尽快在一小时内测出。

三线粒锥体细胞膜位能的测出

线粒锥体在真核细胞衰老的过程中所起着枢纽站效用,多种真核细胞衰老诱发因子都可作用于不同的真核细胞遭遇衰老,而线粒锥体地一区性细胞膜电位(Δψm)的急剧下降,被认为是真核细胞衰老级联赞成过程中所最早遭遇的暴力事件,它遭遇在真核细胞核能衰老不同之处(漂白质稀释、DNA 塌陷)不止现前,一旦线粒锥体地一区性细胞膜电位崩溃,则真核细胞衰老不可逆转。

线粒锥体地一区性细胞膜电位的实际上,使一些亲脂性金属离子发光原料如 Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide(DiOC6)、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide(JC-1)、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可联结到线粒锥体动物细胞,其发光的赞强或减慢暗示线粒锥体内细胞膜配位的增极低或增加。

方具锥体新方法

将短整整培养出来的真核细胞和作用于衰老的真核细胞自组使用逐ppm为 Rhodamine 123(1 mM)或逐ppm为 DiOC6(25 nM),JC-1(1 mM),TMRM(100 nM),37 °C 平衡 30 min,流式真核细胞而所测出真核细胞的发光切变。

注意事项

1. 始逐保持稳定染盐酸中所 pH 绝对值的一致性,因为 pH 绝对值的变化将影响细胞膜电位。

2. 与原料大幅提高平衡的真核细胞悬盐酸中所如果成分细胞,他们将与部分原料联结,增加原料的ppm,引来假去极化。

四DNA 短片化测出

真核细胞衰老时主要的生化不同之处是其漂白质遭遇稀释,漂白质 DNA 在核能小锥体单位之间的连接处塌陷,形成 50~300 kbp 短的 DNA 成短片,或 180~200 bp 整数倍的寡核能苷酸短片,在GC上乏善可陈为梯形液相平面图谱(DNA ladder)。

真核细胞经检视后,改用这两项方具锥体新方法转化提纯 DNA,展开琼脂糖GC和溴化乙啶漂白,在衰老真核细胞群中所可仔细观察到迥然不同的 DNA ladder。如果真核细胞绝对值很少,还可在转化提纯 DNA 后,用 32P-ATP 和底物核能苷酸末端甘氨酸(TdT)上面 DNA,然后展开液相和不放射自照相机,仔细观察衰老真核细胞中所 DNA ladder 的形成。

大底物漂白锥体 DNA 短片的测出

真核细胞衰老的最初,漂白锥体塌陷被选为 50~300 kbp 短的 DNA 成短片。所有将近一定底物绝对值较小的双链 DNA 底物在琼脂糖胶体中所的迁移速度相同。等价 DNA 的螺旋形半径将近胶体半径时,即大幅提高分辨力的趋近。此时胶体不再按底物绝对值的较小来筛分 DNA,DNA 像通过弯管一样,以其末端指向作用力一极而通过胶体,这种迁移方式在称之为「攀行」。因此,真核细胞衰老最初造成了的 50~300 kbp 短的 DNA 成短片不能用普通的琼脂糖GC来转化。

通常改用脉冲液相技拳法可圆满地解决这一解决办法。这个方具锥体新方法是在胶体上除此以外正则的交变脉冲作用力。每当作用力方向转变后,大的 DNA 底物便滞留在攀行气管所,以后新的作用力轴重新定向后,才能继续向前移动。DNA 底物绝对值越大,这种重排所需要的整整就越短。当 DNA 底物变换方向的整整极小电脉冲周期时,DNA 就可以按其底物绝对值较小分开。

DNA Ladder 测出

方具锥体新方法

进帐真核细胞(1×107)结晶→真核细胞混合物盐酸→13 000 rpm ×5 min→收集上清,赞 1% SDS 和 RnaseA(5 mg/ml)56 °C,哺育 2 h→细胞蛋白酶 K(2.5 mg/ml)37 °C,2 h→1/10 锥大小 3 mol/l 醋酸钠和 2.5 倍锥大小的冷无水乙醇结晶 DNA,4 °C 驱车→14 000 rpm×15 min→最后将结晶溶解在 TE buffer 中所,赞 DNA Loading Buffer→1.2% 琼脂糖GC,EB 漂白并底片。

结果

衰老真核细胞 DNA 分作绝对值的流式真核细胞而所比对

方具锥体新方法

收集真核细胞→70% 冷乙醇(PBS 稀释)4 °C 固定驱车→PBS 浸涤,1 000 rpm × 10 min→RNase A(0.5 mg/ml)37 °C 小肠 30 min→PI(50 mg/ml)漂白,熔点避光 15 min→FACScan 比对 DNA 亚母细胞的形成及真核调控的变化。

结果

ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay

优点:敏感度极低,适合于测出少绝对值采样,小部分衰老真核细胞。如临床活组织起来测出。

五TUNEL 具锥体新方法

真核细胞衰老中所,漂白锥体 DNA 双链塌陷或脱氧核糖核酸塌陷而造成了大绝对值的粘性 3'-OH 末端,可在底物核能苷酸末端甘氨酸(TdT)的效用下,将底物核能苷酸和发光素、过氧化物蛋白酶、中性磷酸蛋白酶或生物素形成的衍生物上面到 DNA 的 3'-末端,从而可展开衰老真核细胞的测出,这类方具锥体新方法称之为底物核能苷酸末端甘氨酸激活的中空洞末端上面具锥体新方法(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于短整整的或正在增殖的真核细胞几乎没有 DNA 的塌陷,因而没有 3'-OH 形成,很少很难被漂白。TUNEL 实际上是底物生物学与特征学相联结的研究成果方具锥体新方法,对完整的单个衰老真核细胞核能或衰老小锥体展开则会漂白,能准确地赞成真核细胞衰老迥然不同的生物化学和特征不同之处,可用于石蜡包埋组织起来切片、溶化组织起来切片、培养出来的真核细胞和从组织起来中所转化的真核细胞的真核细胞特征测出,并可测出不止都只的衰老真核细胞,因而在真核细胞衰老的研究成果中所被相当多改用。

六Caspase-3 活性的测出

Caspase 家族在激活真核细胞衰老的过程中所起着非常最重要性的效用,其中所 Caspase-3 为最重要的执行底物,它在衰老路径作用于的许多种系统中所发挥机制。Caspase-3 短整整以蛋白酶原(32 KD)的基本上实际上于胞浆中所,在衰老的最初阶段,它被激活,再造的 Caspase-3 由两个大蛋白质(17 KD)和两个小蛋白质(12 KD)都由,混合物相应的胞浆胞核能底物,最逐造成真核细胞衰老。但在真核细胞衰老的更早和活着亡真核细胞,Caspase-3 的活性引人注意急剧下降。

Western blot

比对 Procaspase-3 的再造,以及再造的 Caspase-3 及对底物多聚(ADP-核能糖)催化反应(PARP)等的混合物。

方具锥体新方法

收集真核细胞→PBS 浸涤→抽提真核细胞混合物盐酸→细胞系统性→SDS-PAGE 液相→纤维素细胞膜或 PVDF 细胞膜转移→5% 脱脂清空,熔点 1.5~2 h 或 4 °C 驱车→Caspase-3 多抗或霉素熔点赞成 1~2 h 或 4 °C 驱车→TBS-T(分作 0.05% Tween 20 的 TBS)浸 3 次,5~10 min/次→HRP-上面的骡抗鼠 IgG 或 AP 上面的骡抗鼠 IgG 熔点赞成 1~2 h→ TBS-T 浸 3 次, 5~10 min/次→ECL 照相机或 NBT/BCIP 显色。

结果

发光光谱郭子光学郭子器比对

再造的 Caspase-3 很难特异切割 D1E2V3D4-X 底物,水解 D4-X 核酸。根据这一在结构上,设而所不止发光物质胺的短肽 Ac-DEVD-AMC。在总共价胺时,AMC 不能被诱发发光,短肽被水解后释不放不止 AMC,民主自由的 AMC 才能被诱发发射发光。根据释不放的 AMC 发光切变的较小,可以测出 Caspase-3 的活性,从而反映 Caspase-3 被再造的程度。

方具锥体新方法

进帐真核细胞短整整或衰老真核细胞→PBS 浸涤→转化出真核细胞混合物盐酸→赞 Ac-DEVD-AMC(caspase-3 发光底物)→37 °C 赞成 1 h→发光光谱郭子光学郭子器(Polarstar)比对发光切变(诱发光波短 380 nm,发射光波短为 430~460 nm)。

结果

流式真核细胞拳法比对

方具锥体新方法

进帐真核细胞短整整或衰老真核细胞→PBS 浸涤→赞 Ac-DEVD-AMC→37 °C 赞成 1 h→UV 流式真核细胞而所比对 Caspase-3 阳性真核细胞数和平仅发光切变。

结果

七TFAR19 细胞暗示和真核细胞取向比对

TFAR19(PDCD5)是由本研究成果室在国际上首先媒体的一个拥有自己知识产权的人类新等位基因,后期的机制研究成果表明,它是促进真核细胞衰老的赞强剂。运用发光素(FITC)上面的 TFAR19 化学疗法为探针,对真核细胞衰老过程中所 TFAR19 细胞的暗示水准及取向研究成果发现,衰老最初 TFAR19 暗示水准增极低并不止现短整整内核能长号现象,随之而来着真核细胞核能特征学的变化,持续较短整整,在衰老小锥体中所无论如何可见。

同时我们发现,衰老最初 TFAR19 细胞的核能长号早于脂类乙基底物(PS)外翻和真核细胞核能 DNA 的短片化,指引 TFAR19 细胞的核能长号是真核细胞衰老更最初遭遇的暴力事件之一。进一步的研究成果假定,衰老最初 TFAR19 的核能长号具有普遍意义,不同真核细胞衰老最初仅不止现 TFAR19 极低暗示和核能长号。这为研究成果真核细胞衰老最初所遭遇的暴力事件,缺少了一种新的技拳法和这两项。

TFAR19 细胞的真核细胞取向比对

材料盐酸

FITC 上面的化学疗法,pH 7.4 、0.15 mol/L PBS,3% 的多聚甲醛,PBS-T(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 分作 0.2% Tween 20),胎牛胰岛素,发光真核细胞浸盐酸(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 分作 2% 胎牛胰岛素及 0.1% NaN3),FACS 管,Tip 头,移盐酸器。

郭子器

低温水准离心机,37 °C 水浴箱,发光全像,总共定位激光扫描全像,流式真核细胞郭子。

方具锥体新方法

1. 碎屑真核细胞的漂白

(1)进帐短整整和作用于衰老的真核细胞(0.5~1×106),PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(2)3% 多聚甲醛冰浴 10 min,PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(3)自组 PBS-T 溶盐酸,37 °C 哺育 15 min,PBS 浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

(4)自组 200 ml 胎牛胰岛素,熔点赞成 30 min。

(5)自组 5 ml FITC 上面的 TFAR19 霉素(逐ppm为 1:40),4 °C 赞成 30 min。

(6)发光真核细胞浸盐酸浸 2 次,1 000 rpm×10 min。

将真核细胞结晶滴片,发光全像及总共定位激光全像下仔细观察 TFAR19 在真核细胞中所的取向。同时用流式真核细胞郭子系统性测出 TFAR19 细胞的平仅发光切变。

2. 贴壁真核细胞的则会漂白

(1)贴壁生短的对数期真核细胞砌成在 24 中空或 6 中空板中所(上有洁净盖玻片),让其攀片生短,待短到 50%~80 % 满时,衰老作用于剂检视真核细胞。

(2)将不同整整点检视的真核细胞展开免疫发光漂白,漂白步骤同上。

(3)将漂白的攀片真核细胞不放于一张滴有少绝对值(5 ml)的载玻片上,发光全像或总共定位激光扫描全像仔细观察 TFAR19 在真核细胞中所的取向。

3. 临床病理切片的漂白、测出

4. 原代真核细胞的培养出来、测出

5. 比对 TFAR19 细胞在人锥体内各组织起来器官的原产及取向

TFAR19 细胞的暗示与临床疟疾

ELISA 具锥体新方法测出短整整人和疟疾精神状态下,以及疟疾的不同时期,胰岛素中所 TFAR19 细胞水准及其 TFAR19 自身抗锥体水准。

材料和盐酸

1. 一般来讲 Buffer:pH 9.6, 0.05 mol/L 碳酸盐 Buffer

2. 浸涤盐酸: pH 7.4,0.15 mol/L PBS 分作 0.05% Tween 20

3. 清空盐酸: 3% BSA(用浸涤盐酸配制)

4. 蛋白酶标抗锥体的稀释:用清空盐酸稀释

5. OPD 底物 Buffer:Na2 HPO4·12 H2O 1.84 g,柠檬酸 0.51 g,DDW 100 ml

6. 显色盐酸(现配现用):底物 Buffer 10 ml,OPD 2 mg,30% H2O2 2 ml

7. 逐止盐酸 2 mol/L H2SO4

8. 改组人 TFAR19,HRP 上面的骡抗人 IgG9 ELISA 板,Tip,移盐酸器,ELISA Reader(OD 490 nm),浸板机

操作步骤

1. 用一般来讲 Buffer 稀释的改组人 TFAR19(1 mg/ml)一般来讲 ELISA 板,100 ml/well,37 °C 哺育 2 h 或 4 °C 驱车(一般 24 h 以上)。

2. 浸涤 Buffer 浸板三次,自组清空盐酸,200 ml/well , 37 °C 哺育 2 h 或 4 °C 驱车。

3. 浸涤 Buffer 浸板三次,自组不同稀释度的患者胰岛素(3 个单调中空)100 ml/well ,37 °C 哺育 1 h。设一般来讲 Buffer、浸涤 Buffer 、清空盐酸为同义相异。

4. 浸涤 Buffer 浸板三次,自组 1:2 500 稀释的 HRP 上面的抗人 IgG, 100 ml/well,37 °C 哺育 1 h。

5. 浸涤 Buffer 浸板三次,自组显色盐酸,100 ml/well,避光赞成 10~15 min。

6. 自组 H2SO4 逐止赞成,50 ml/well。

7. ELISA Reader 读取 OD 490 光密度绝对值,比对和比较患者胰岛素和短整整屑 清中所 TFAR19 自身抗锥体的暗示水准。

8. Western blot 比对原发性真核细胞和短整整真核细胞的 TFAR 19 细胞的暗示水准。

的有

Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039

Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-5507

文章举例来说:丁香苑站友 midas

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撰稿人: 任悠悠

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