Nature:肠道微生物代谢产物新功能,促进HDAC3酵素

2022-02-07 00:25:07 来源:
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哺乳动物体内和对其有益的共生有机物的合作进化导致了体内-有机物关系的的发展。微小性状修饰使得哺乳动物蛋白质需要整合外界生态频率,有利于蛋白质对生态的适应能力。但是以前以来共生的消化道有机物是从的多种频率移动式和多种生态频率是如何精密缺少性的还不甚为清楚。

消化道淋巴位于有机物群和体内彼此之间的图形界面,有利于极为不可忽视屏障的形成,在身心健康以前和重击以前对消化道内膜顺利进行多余。维持消化道淋巴分化过程里有多种微小性状选择性参与其里,其里HDACs的表示对于消化道周期性非常极为不可忽视。消化道有机物是从的短链脂肪酸甲醛水(Butyrate)在人体内选择性HDAC活性,甲醛水处理方式后的消化道组织淋巴里HDAC活性减少。在新鲜仓鼠里植入产甲醛水的消化道有机物可能会选择性消化道淋巴里HDAC的活性。这些结果都说明了消化道有机物是从的甲醛水选择性HDAC的活性。但是消化道有机物与遗传物质干乙酰化赖氨酸彼此之间的缺少性选择性是怎样的还确切。

近日,加拿大辛辛那提儿童医院医疗里心Theresa Alenghat研究组在Nature月刊上社论 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,辨认出消化道有机物是从的激酶腺苷水需要调节消化道内遗传物质干乙酰化酶HDAC3的活性从而有利于消化道淋巴的修补,彻底改变了体内对于消化道有机物频率作出反应的基本选择性。

为了彻底改变消化道有机物则有激素副产物与微小性状频率彼此之间的关系,编者们对野生DF以及消化道淋巴HDAC3敲除大仓鼠里的HDAC活性进性扫描,辨认出野生DF非常少大仓鼠里的HDAC3表示情况下并且不具备比较稳定的赖氨酸,但是消化道淋巴HDAC3敲除大仓鼠则相反。编者们想真的HDAC3究竟可能会特异性调节消化道有机物脆弱的频率游离。编者们辨认出HDAC1与HDAC2在消化道淋巴里也有表示,但并不能补偿消化道淋巴里HDAC3表示的纠正。而且在对新鲜仓鼠和消化道淋巴HDAC3敲除大仓鼠里的消化道淋巴持续性HDAC广谱选择性剂处理方式后,辨认出在HDAC3敲除后其他种类的HDACs始终不具备活性。这些结果说明了消化道有机物有利于淋巴里HDAC3在情况下消化道周期性里的赖氨酸。

为了破译消化道有机物激活HDAC3的基本选择性,编者们对新鲜仓鼠和情况下培养的大仓鼠里消化道淋巴里的转录谱顺利进行解析。编者们辨认出在消化道有机物存有的淋巴里与激酶腺苷激素相关的突变被广泛游离表示。前人的研究辨认出激酶三腺苷(Inositol trisphosphate)可能会通过强化HDAC3与激活蛋白的相互作用来提高HDAC3的活性。编者们辨认出再加激酶三腺苷的确可能会特异性提高HDAC3-NcoR私营化蛋白的活性,NcoR蛋白对于HDAC3的干乙酰化赖氨酸非常极为不可忽视。

实质性地,编者们想真的新鲜仓鼠与非常少的大仓鼠消化道彼此之间激酶三腺苷准确度究竟存有关联性。编者们辨认出非常少大仓鼠里无论是肠腔还是消化道淋巴里激酶三腺苷的准确度都显著高于新鲜仓鼠,说明了消化道有机物的存有有利于激酶三腺苷准确度的提高。为了分析激酶三腺苷对于消化道淋巴里HDAC3活性的影响,编者们对消化道淋巴里的HDAC3蛋白顺利进行制备并与激酶三腺苷顺利进行合作孵育,辨认出激酶三腺苷的确需要提高内源HDAC3的活性。而且甲醛酰胺造成的HDAC3活性的选择性也可以被激酶三腺苷所拮抗。另外,编者们还辨认出共生的消化道有机物可能会通过激酶六腺苷(Phytate)激素必需有利于消化道淋巴里的HDAC3的特性。与激酶三腺苷相似,激酶六腺苷也可能会游离消化道淋巴里的HDAC3的活性。

为了扫描消化道有机物激酶六腺苷缺少的激素对于HDAC活性的影响,编者们对定植野生DF以及激酶六腺苷酶纠正DF酵母菌的大仓鼠顺利进行分析。编者们辨认出定植激酶六腺苷酶情况下表示酵母菌的大仓鼠相较于新鲜仓鼠以及激酶六腺苷纠正DF酵母菌大仓鼠的激酶三腺苷准确度升高。对大仓鼠顺利进行右旋糖酐酰胺钠(Dextran sodium sulfate, DSS)处理方式后,可能会游离大仓鼠激发消化道哮喘。为了扫描激酶三腺苷在DSS处理方式游离的消化道哮喘里的作用,编者们对新鲜仓鼠持续性激酶三腺苷后辨认出激酶三腺苷需要有利于消化道从哮喘里恢复并提高新鲜仓鼠的生命期。DSS游离的肝硬化类似于治疗里溃疡性肝硬化。为了实质性确认消化道有机物激素副产物的特性,编者们对有机体整合有机物组学著手(Integrative Human Microbiome Project)里的身心健康采样以及溃疡性肝硬化患者的探针顺利进行扫描,辨认出在溃疡性肝硬化治疗消化道里激酶六腺苷酶的重元素数倍低于身心健康采样之里,说明了激酶六腺苷对于消化道重击修补是需要的。

总的来说,Alenghat研究组的工作辨认出相较于新鲜仓鼠,消化道有机物存有的大仓鼠里HDAC3活性显著降低,这一降低是通过共生的消化道有机物比如酵母菌激酶六腺苷以及激酶三腺苷的激素形成的。另外,激酶三腺苷可能会游离治疗是从的消化道类器官的落叶、冲动HDAC3缺少的代谢物以及拮抗甲醛酰胺引起的消化道落叶选择性,可能会有利于消化道哮喘里淋巴的修补。因此,编者们鉴定辨认出了HDAC3作为体内作出反应多种消化道有机物频率的汇聚微小性状因子的不可忽视特性,彻底改变了消化道有机物、微小性状因子以及有机物激素副产物在消化道内膜以及消化道哮喘里的不可忽视缺少性和修补作用。

原始说是:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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